Sauter señaló que uno de los principales problemas es la deuda acumulada de programas nacionales como Incluir Salud, que llegó a estar sin pagar desde diciembre y cuyos montos, incluso cuando se actualizan, no alcanzan a cubrir los gastos reales. En ese sentido, indicó que los ingresos se destinan principalmente a cubrir sueldos y obligaciones básicas, en un contexto donde los costos —como transporte, combustible y mantenimiento— superan ampliamente los valores reconocidos.
Actualmente, la institución enfrenta un déficit mensual de entre 20 y 25 millones de pesos, lo que dificulta sostener el funcionamiento institucional. A esto se suma que la mayoría del personal depende directamente de los ingresos que genera la entidad, mientras que los aportes estatales resultan limitados. Desde NICADPI también remarcaron la importancia de la colaboración de la comunidad y el fortalecimiento de campañas de socios, ante un escenario en el que las organizaciones deben cubrir roles que muchas veces corresponden al Estado.

